Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms