Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms