Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms