Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms