Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf130Q8VEM1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf130Q8VEM1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf130Q8VEM1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf130Q8VEM1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf130Q8VEM1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf130Q8VEM1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf130Q8VEM1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf130Q8VEM1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf130Q8VEM1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf130Q8VEM1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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