Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ccdc71Q8VEG0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ccdc71Q8VEG0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ccdc71Q8VEG0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ccdc71Q8VEG0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ccdc71Q8VEG0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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