Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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