Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Smg8Q8VE18 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Smg8Q8VE18 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Smg8Q8VE18 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Smg8Q8VE18 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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