Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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