Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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