Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssx2ipQ8VC66 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx2ipQ8VC66 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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