Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms