Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim29Q8R2Q0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms