Protein–RNA interactions for Protein: Q8R139

Slc29a4, Equilibrative nucleoside transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc29a4Q8R139 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc29a4Q8R139 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc29a4Q8R139 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms