Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec12Q8K4Q8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms