Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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