Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccm2Q8K2Y9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms