Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm48Q8K2X2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rbm48Q8K2X2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rbm48Q8K2X2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rbm48Q8K2X2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rbm48Q8K2X2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rbm48Q8K2X2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rbm48Q8K2X2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rbm48Q8K2X2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rbm48Q8K2X2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rbm48Q8K2X2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rbm48Q8K2X2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm48Q8K2X2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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