Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Depp1Q8K2F3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms