Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

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Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gtf3c1Q8K284 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c1Q8K284 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c1Q8K284 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c1Q8K284 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c1Q8K284 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c1Q8K284 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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