Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms