Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms