Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syn3Q8JZP2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 333.2 ms