Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms