Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms