Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab43Q8CG50 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab43Q8CG50 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rab43Q8CG50 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rab43Q8CG50 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rab43Q8CG50 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rab43Q8CG50 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rab43Q8CG50 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab43Q8CG50 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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