Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ercc8Q8CFD5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ercc8Q8CFD5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ercc8Q8CFD5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ercc8Q8CFD5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ercc8Q8CFD5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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