Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec10Q8CF98 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms