Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms