Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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