Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd4aQ8CBY1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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