Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms