Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms