Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms