Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms