Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms