Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms