Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms