Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hdac7Q8C2B3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hdac7Q8C2B3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hdac7Q8C2B3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hdac7Q8C2B3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hdac7Q8C2B3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hdac7Q8C2B3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hdac7Q8C2B3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms