Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms