Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ccser1Q8C0C4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ccser1Q8C0C4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ccser1Q8C0C4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccser1Q8C0C4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccser1Q8C0C4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccser1Q8C0C4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccser1Q8C0C4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms