Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp47Q8BY87 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp47Q8BY87 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp47Q8BY87 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp47Q8BY87 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp47Q8BY87 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp47Q8BY87 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Usp47Q8BY87 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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