Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctxn3Q8BXZ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctxn3Q8BXZ0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms