Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms