Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms