Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms