Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD5

She, SH2 domain-containing adapter protein E, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SheQ8BSD5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SheQ8BSD5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SheQ8BSD5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SheQ8BSD5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SheQ8BSD5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SheQ8BSD5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SheQ8BSD5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SheQ8BSD5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SheQ8BSD5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SheQ8BSD5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SheQ8BSD5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms