Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BP99 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BP99 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BP99 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BP99 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BP99 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BP99 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BP99 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BP99 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Q8BP99 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Q8BP99 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BP99 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Q8BP99 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Q8BP99 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Q8BP99 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BP99 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Q8BP99 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8BP99 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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