Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sfr1Q8BP27 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sfr1Q8BP27 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sfr1Q8BP27 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sfr1Q8BP27 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sfr1Q8BP27 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sfr1Q8BP27 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sfr1Q8BP27 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sfr1Q8BP27 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sfr1Q8BP27 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfr1Q8BP27 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms