Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms